Η ελιά ανθίζει τον Απρίλιο-Μάιο και τα άνθη της παρότι φυτρώνουν πολλά μαζί (15-25), δε μυρίζουν.  Είναι μικρά πρασινόλευκα ή κιτρινόλευκα άνθη που διατάσσονται κατά ταξιανθία, βγαίνοντας από τις μασχάλες βλαστών της περασμένης χρονιάς.  Είναι ερμαφρόδιτα, με κυπελλοειδή μονοσέπαλο κάλυκα με τέσσερα δόντια, στεφάνη τετράλοβη που μοιάζει με μικρό αυγό, δύο στήμονες με πολλή γύρη και ωοθήκη επιφυή, δίχωρη.  Υπάρχουν όμως και ατελή άνθη με ατροφικό ύπερο, τα οποία εξασφαλίζουν τη διασταυρωτή γονιμοποίηση και έπειτα πέφτουν.  Η επικονίαση γίνεται από τον άνεμο.