Η ιστορία της Σαντορίνης δεν είναι μόνο μια ιστορία ανθρώπων αλλά μια ιστορία που έχει το προνόμιο να εξελίσσεται και να διαμορφώνεται συνεχώς από μόνη της. Για να το συλλάβει αυτό κανείς όμως θα πρέπει να σκεφτεί ότι κάποτε στις Κυκλάδες δεν υπήρχε αυτό το νησί και πως από την έκρηξη ενός ηφαιστείου γεννήθηκε. Η ιστορία της Σαντορίνης είναι μια ιστορία ενός τόπου που δεν είναι δεδομένος και που πρέπει κάθε τόσο να γίνεται από την αρχή. Οι πρώτοι κάτοικοι της Σαντορίνης ήταν οι Προέλληνες που εμφανίστηκαν γύρω στο 3000 π.Χ.

Μυθολογία: δεν αποκλείεται ο μύθος του Δευκαλίωνα και της Πήρας που γλίτωσαν από τον καταυλισμό που προκάλεσε ο Δίας για να τιμωρήσει τους ανθρώπους να έχει άμεση σχέση με την έκρηξη της Σαντορίνης. Χρονολογικά ο καταυλισμός αυτός τοποθετείται ανάμεσα στο 1530 και στο 1400 π.Χ. άλλος μύθος σχετικός με πλημμύρα είναι η θυμωμένη αντίδραση του Ποσειδώνα που πλημμύρισε την Αττική όταν έχασε στο συναγωνισμό με την Αθηνά για τη κυριαρχία της Αθήνας. Εξάλλου ο θάνατος του Ιππόλυτου οφείλεται σε ένα τεράστιο κύμα που σήκωσε και πάλι ο Ποσειδώνας κοντά στη Τροιζήνα.

Αρχαίοι χρόνοι: σιγά – σιγά οι άνθρωποι ύστερα από το ηφαίστειο ξανάρχισαν τις φυσιολογικές τους δραστηριότητες. Για τους πρώτους ανθρώπους που πήγαν στο νησί ξέρουμε λίγα από τη μυθολογία. Ότι ήταν Φοίνικες που γύρω στα 1300 π.Χ. τους τράβηξε εκεί η ομορφιά του τόπου. Αργότερα ήρθαν οι Δωριείς με βασιλιά τον Θήρα και ονόμασαν το νησί : Θήρα.

Βυζαντινή περίοδος: η Σαντορίνη τον 3ο αιώνα έγινε έδρα επίσκοπου με επίσκοπο τον Διόσκουρο. Από την εποχή του Ιουστινιανού η Σαντορίνη υπάγεται στη μητρόπολη της Ρόδου. Το πιο βυζαντινό μνημείο της Σαντορίνης είναι το εκκλησάκι της Παναγίας Επισκοπής γωνιάς χτισμένο από τον αυτοκράτορα Αλέξιο Α΄. τον Κομνηνό.

Φραγκοκρατία και μεταγενέστεροι χρόνοι: οι Φράγκοι ήρθαν στη Θήρα το 1204. Τη βάφτισαν Σαντορίνη. Από αυτή τη στιγμή αρχίζει μια περίοδος διαμάχης ανάμεσα στους δούκες της Νάξου και στους δούκες της Σαντορίνης, προσπάθειες των κατοίκων για την απελευθέρωση του νησιού. Μόνο μια φορά το νησί πέρασε ειρηνικά όταν ο δούκας της Νάξου το έδωσε προίκα στη κόρη του.ΙΣΤΟΡΙΑ

Αλλά και αυτό δεν κράτησε πολύ γιατί διαφωνούσε ο θείος της νύφης και όταν ανέβηκε στην εξουσία το πήρε πίσω. Όταν η Σαντορίνη προσαρτήθηκε στην οθωμανική αυτοκρατορία τα πράγματα ηρέμησαν. Το νησί σιγά – σιγά ασχολήθηκε με το εμπόριο και έφτιαξε δικό του στόλο. Το 1821 ο στόλος του νησιού βγήκε τρίτος στην Ελλάδα.